公积金贷款逾期三个月，将面临一系列不利后果。例如，小李在2022年通过住房公积金贷款购买了一套价值100万元的房产，贷款期限为10年，月供4000元。由于工作原因，小李在2023年7月开始未能按时还款，直到9月份才补上逾期款项。根据相关规定，公积金贷款逾期三个月后，银行将暂停发放剩余贷款额度，并向借款人收取罚息。

对于小李的情况，逾期后的处理方式和影响具体如下：

贷款逾期将导致信用记录受损。小李的信用报告中将被标注逾期信息，这不仅会影响其个人信用评分，还会对其未来申请其他金融产品造成不利影响。银行通常会将逾期情况上报至中国人民银行征信中心，从而对小李的信用记录产生负面影响。一旦小李的信用评分下降，可能会影响到未来的购房、购车或申请信用卡等需求。

银行将暂停发放剩余贷款额度，并收取罚息。根据银行的规定，小李在贷款期间内连续三个月未按时还款，银行有权暂停发放剩余贷款额度。这意味着小李的贷款总额度将被冻结，无法继续使用。银行还将按照合同约定向小李收取罚息，以弥补因逾期而产生的损失。假设罚息率为0.05%，那么小李将需要额外支付1500元的罚息。

银行将采取催收措施。银行通常会在贷款逾期后的一段时间内进行催收，包括电话、短信、信函等方式提醒借款人尽快还款。若借款人仍未及时还款，银行将采取进一步措施，如上门催收、法律诉讼等。对于小李而言，银行可能会通过电话、短信等方式多次提醒其尽快还款，若仍未还款，银行将采取法律手段进行追偿。

小李可能需要承担提前还款的责任。如果小李希望继续使用贷款，他需要一次性偿还所有未还本金及相应罚息，才能恢复贷款额度。银行可能要求借款人提供相应的担保或抵押物作为保障。对于小李来说，如果希望继续使用贷款，他需要一次性偿还所有未还本金及相应罚息，才能恢复贷款额度。否则，银行有权宣布贷款提前到期，要求借款人立即偿还全部剩余贷款本息。

公积金贷款逾期三个月将给借款人带来诸多不利影响。为了避免上述后果，建议借款人应合理规划财务，确保按时还款。若遇到特殊情况导致无法按时还款，应及时与银行沟通协商解决方案，避免产生不必要的经济损失。